在十三五期间，随着精准脱贫的不断深入，很多地方把见效快，收益相对高的中药材作为精准脱贫的一个重要抓手，中药材种植面积在十三五也大幅度增加。在十四五期间，随着乡村振兴战略的实施，我相信，中药材种植面积应该会处在一个比较稳定的区间。但是由于中药材自身的特殊性，很多对中药材不太了解的种植户、合作者或者企业投入到这个行业，进行大面积的种植，最后很多时候导致比较经济效益和理想中的差别太大，有些甚至因为面积过大，不能精细化管理，导致最后绝收或者减产，造成了很大的经济损失，因此，一定要对中药材种植的困难和挑战有一定的了解。
一、种植土地成本增加
由于逐步增大的市场需求，我们有效的种植面积和市场需求形成了矛盾，土地资源受限，土地成本过高，严重地影响了药材的种植成本，现在的土地成本和前五年比在很多地方几乎翻了一番，个别地方地租达到每亩每年-元。据我们调查，在焦作、武陟一带，由于四大怀药种植经济效益不错，每亩地的租地成本在元左右，而在南阳、信阳一带，每亩地的租地成本在元左右。
二、劳动力成本高，机械化程度低，严重影响规范化的发展
中药材种植属于精细化管理。与大田作物相比，中药材种植的机械化程度较低，从种植、中耕、除草到收获，专用的机械比较少，很多环节都需要人工，人工投入比较大，目前，劳动力由原来每天20-40元已经升到80-元，使药材从种植到采收都面临着成本高、收益低。同时，目前市面上还没有中药材种植专门的除草剂，导致除草主要依靠人工，就这一块，差不多每一季都需要三到五次的人工拔草，成为主要的劳动力投入环节，大大的提高了劳动力投入成本。
三、种植质量意识差
由于中药材种植零散为主，尤其是中药材于其他大田作物不同，中药材追求“高质适产”，很多中药材种植户以“产量”为目标，缺乏标准化种植意识，导致药材的有效成分和副作用问题较多，严重地影响着药品的疗效和出口的要求。
四、国家对药材种植的扶持政策太少、扶持力度太小。
很多地方政府都没有专门的药材管理的行政机构，很多地方都把药材管理按农作物管理。但是和其他大田作物相比，小麦、玉米、大豆等每年国家都有相应的收购补贴、种植补贴、机械补贴等惠农政策，但是对于中药材种植来说，缺没有享受农业的相关扶持政策，中药材种植的补贴较少，农民可根据市场行情，随意调整种植规模和品种，使市场需求很难得到稳定的保障。尽管这几年，国家对中药材越来越重视，也出台了一些列的法律法规来保障中药材产业的发展，但是很多地方上仍然缺乏配套的中药材种植扶持政策。
五、管理体制不健全
目前在我国中药材种植户基本上都是以个人为主的种植个体，或者是松散的合作社，这样就很难有相对稳定的管理体制，很难保证种植的规范有序发展。